Créée le 14/08/1996, l’Université Protestante de l’Equateur est une oeuvre commune de deux Eglises Protestantes: ECC/22ème CADELU et ECC/10ème CDCC. Elle est localisée à Mbandaka, chef-lieu de la Province de l’Equateur, dans l’enceinte de la Mission Protestante Bolenge. Elle a commencé avec la faculté de Théologie qui a sorti déjà 16 promotions, aujourd’hui la faculté des Sciences économiques et gestion s’est ajoutée.
En dehors des étudiants qui proviennent des deux communautés, c’est-à-dire CADELU et CDCC, l’Université Protestante de l’Equateur (U.P.E.) reçoit également d’autres étudiants qui sont envoyés par les communautés membres de l’Eglise du Christ au Congo.
Elle est dirigée actuellement par les membres issus de deux communautés. Rév Dr KONDEMO est l’actuel Recteur.
Elle comporte 68 étudiants (63 Hommes et 5 femmes), 19 enseignants (17 hommes et 2 femmes), et 5 salles de classe.